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ChemBio3D Ultra是一款化学结构式画图软件,通过观察3D分子模拟图形,研究化合物的三维结构,预测化合物属性和特异性,在ChemDraw里搭建有机小分子、观察3D结构。
ChemBio3D Ultra软件特色
1、可视化建模
通过3d建模、可视化和计算等功能,科学家能够更好、更快地确定出研究重点,从而提高生产力,快速达成研究目标。学生则可以使用ChemBio3D Ultra官方版更加深入地认识分子的3D空间结构及对其属性所产生的影响。
2、2D与3D模式结构互换
ChemBio 3D集成ChemBioDraw,可简化2D和3D模式之间的结构互换,科学家能够研究小分子和生化制剂的三维形状及属性,并且使合成化学家与计算化学家之间的交流更有效和开放。
3、丰富的应用接口
ChemBio 3D经济实用,充分满足大多数科学工作者的需求,同时也能提供与其它应用程序的接口,满足用户对更高级功能的需求。这款程序在普通桌面系统上即可运行,无需配备高性能和高端制图功能的系统。
4、兼容多款程序、准确预测结果
ChemBio 3D包括多个可选版本,如半经验建模程序MOPAC、半经验和从头开始的Gaussian分子轨道计算,并可连接到从头计算程序GAMESS以及可处理柔性配体的自动对接程序AutoDock。
ChemBio3D Ultra功能介绍
3D眼镜
(W)包括眼镜提供增强的立体声模式与深度的阴影,给现实的三维效果图质量的所有结构。(包括在光盘购买而已。)
自动覆盖
(W)选择多个分子结构,自动对齐靶分子。
ChemDraw盗链
(W)同时2D和3D编辑!使用ChemDraw窗口嵌入在Chem3D画结构的应用。这个强大的功能,增加了一个二维视图,总是在3D视图同步。
chemprop
(W)先进的性能参数包括BP、MP和更多。
ClogP
(W)ClogP产权服务器提供计算的正辛醇/水分配系数的新方法。
二面角驱动
(W)新的构象分析工具允许MM2能量图的生成。
增强的图形
(W)c hem3d使用OpenGL提供高质量的图形显示。
正式指控
(W)分配形式电荷原子和结构将产生离域自动充电。
GAMESS接口
(W)结构的界面会。
组标签
(W)在结构模型视图显示组的标签。
氢键
(W)自动显示氢键在3D视图!
凯库勒/异于寻常的显示模式
(W)之间的虚线和交替的离域和芳香键单双键表示切换。
逻辑
计算分配系数D值的对数,这是所有形式的化合物的浓度之和的比值(电离和非离子化)在一个阶段。
日志
计算一个化合物的溶解度值的对数。这个值显著影响其吸收和分布特征。
mm2
(W)内置mm2生成逼真的三维结构的支持。
MMFF94
(W)MMFF94是分子力学力场支持有机分子和生物大分子。MMFF94力场提供更丰富的原子类型设置为。使MMFF94计算多处理器支持。
模型资源管理器
(W)为探索大型模型的分层树结构的控制。进口Pdb文件和检查链,组,和配体。这个新功能提供了细粒度的控制。
分子建模与动力学
(W)工作站质量的分子模拟。
MOPAC接口
(W)接口的异构结构。(注:MOPAC应用要求。见应用包括部分澄清。)
支援多重处理器
使MMFF94计算多处理器支持。
局部表面
(W)生成和显示对蛋白质的活性位点的局部表面。
PKA
计算出的酸离解常数Ka值的对数,这就是溶液中酸的强度的定量测量。
幻灯片演示文稿软件
(W)嵌入结构模型在PowerPoint文件。旋转和缩放结构模型演示文稿时。
保存到Dropbox
使用云存储通过Dropbox保存在一个安全的可共享的云的位置共享和进口chembio3d模型。
Schr dinger捷豹?接口
(W)接口?薛定谔薛定谔Chem3D捷豹,从头计算软件包。(注:捷豹的应用要求。见应用包括部分澄清。)
光谱分析仪
(W)显示来自捷豹,高斯谱的计算结果,并会在单独的窗口中的图形显示。
随机构象分析
使用随机构象跳跃法测定分子的低能量极小。
结构浏览器
(W)可以让用户轻松浏览一系列的小分子和比较它们的结构和性质。
ChemBio3D Ultra使用方法
1 下载完成后不要在压缩包内运行软件直接使用,先解压;
2 软件同时支持32位64位运行环境;
3 如果软件无法正常打开,请右键使用管理员模式运行;